Het Handboek Loonheffingen 2025 is in oktober 2025 aangevuld en aangepast met een reeks verduidelijkingen en correcties, voornamelijk gericht op de vrije ruimte binnen de werkkostenregeling en gebruikelijkheidstoets, elektronische handtekeningen en loonadministratie. Ook zijn diverse tekstuele aanpassingen doorgevoerd zonder inhoudelijke wijzigingen. Voor specifieke onderwerpen zoals fooien, personeelsleningen en expatregelingen zijn voorbeelden en richtlijnen toegevoegd of verduidelijkt.

Daarnaast zijn technische elementen, zoals het gebruik van tijdvakken en berekeningen inzake loonkostenvoordelen of premies, verduidelijkt of uitgebreid met nieuwe voorbeelden. Ook ingrijpende wijzigingen, zoals het afschaffen van vakantiebonsystemen en de partiële buitenlandse belastingplicht, zijn opgenomen. Voor grensoverschrijdend werken is aandacht besteed aan de belasting- en sociale zekerheidsregels, inclusief specifieke richtlijnen voor expats.

Ten slotte zijn praktische zaken, zoals het vinden van betalingskenmerken en het corrigeren van aangiften, inzichtelijker gemaakt. Voor meerdere onderwerpen zijn kopjes toegevoegd of herschikt voor betere navigatie, zoals bij de eindheffing en vergoedingen voor elektrische laadpalen. Werkgevers wordt geadviseerd om bij twijfel over specifieke details of nieuwe wijzigingen in het handboek de desbetreffende paragrafen te raadplegen.